肾域·科研

使用说明

面向课题负责人(PI)、主治医生、研究护士 / 临床研究协调员(CRC)和受邀分中心成员
一个研究随访登记工作台:知道谁该随访,录得进来,导得出去

用研究编号登记患者,工作台按随访间隔提示谁逾期、谁快到期;随访可由患者通过随访链接在手机上填写,也可由研究人员在工作台直接录入;数据质控问题处理后,冻结一个数据版本导出分析。先用模拟数据走一遍,再按伦理批准的范围录入研究数据。

快速上手:7 步跑通一个项目

引号中的文字与工作台上的按钮或栏目名称一致。“项目”是工作台里的基本单位,一个项目对应一个研究队列。

  1. 注册在注册页用自己的邮箱注册并完成邮箱验证,登录后进入工作台。每位成员使用自己的账号,不共用密码。
  2. 建项目在“项目 → 新建项目”填写项目名称、中心代码并选择病种模块,点创建项目。负责人可在“项目设置(仅项目负责人)”里按研究方案修改随访间隔(默认 90 天)。
  3. 录第一例在“新增患者(建立基线)”填写研究编号、性别、出生年份和已有的基线指标,点核对并保存基线。只填研究编号,不填姓名、电话、身份证号或病案号;基线血肌酐(Scr)按 μmol/L,尿蛋白/肌酐比值(UPCR)按化验单选择单位。
  4. 生成随访链接在“随访看板”该患者一行点随访链接,再点生成新链接,立即复制并只发给该患者或授权填写人。链接只在生成时显示一次,之后无法再次查看;不再需要或发错时在同一窗口撤销。
  5. 录随访患者打开链接核对后提交;患者不方便时,研究人员在“随访看板”该患者一行点录入随访直接录入。收缩压一栏可直接输入“130/80”;连续录多位患者可点“保存并录下一位”。
  6. 看数据质控问题在“数据质控问题”点查看未解决的问题,逐条点核对原记录,对照原始报告更正并填写原因。确认原值无误、无法更正时才选“接受不修复”,它不会修改原值。
  7. 导出在“导出与快照”点冻结并导出完整分析包,得到一个冻结数据版本(数据、校验值和分析脚本)。需要负责人或分析协作人权限;导出的分析脚本在自己电脑上运行,见进阶。
本次新增:工作台可以直接“录入随访”,不必先发链接;“随访看板”按项目的随访间隔标出逾期、14 天内到期和尚无随访的患者,逾期者排在最前;每位患者可在“研究状态”中记录知情同意与随访状态;随访链接可在患者一行集中查看和撤销。

资料下载(PDF)

图文版说明,可下载后转发给课题组成员或机构同事。文中截图和示例全部为人工合成数据,不含任何真实患者信息;功能以网站当前版本为准。

有使用问题,也可以点页面右下角的“使用问答”。

使用前先确认三件事

  1. 研究授权:由课题负责人和所在机构确认研究方案、伦理审批(或适用的豁免)、知情同意、参与人员与数据用途。注册账号或试用不代表研究已获批准。
  2. 数据范围:只登记获批准的研究编号和字段。姓名、电话、身份证号、病案号以及“研究编号—姓名”对照表留在医院按规定保管。用研究编号替代姓名属于去标识化,不等于匿名化,记录仍按敏感个人信息管理,详见研究授权、同意与隐私。
  3. 数据存放位置与试用规则:网页、账户认证与登记数据库目前均部署在中国境内(阿里云上海),具体以隐私政策中的说明为准;机构如有院内部署等额外要求,请在录入真实数据前与我们确认。试用规则:30 天免费试用 · 含 1 个项目 · 注册无需付款信息 · 到期后转为只读,已录数据可继续查看和导出。

成员与角色

项目创建者是负责人。同事先用自己的邮箱注册并完成验证;负责人在“项目信息与协作成员”中填写同事的注册邮箱、选择角色,点添加成员。系统不会自动发送邀请邮件,请另行告知对方登录。分中心成员按同样方式加入,只能看到被授权的项目。

完整权限表、成员离组与到期后的权限见详细手册 · 成员权限。

日常随访与核对

逐步操作见日常录入流程、随访链接、字段与单位和数据质控问题与更正;批量导入见CSV 批量导入。

冻结导出与分析

“冻结并导出完整分析包”会把当前项目在同一时刻的数据保存为一个冻结数据版本,并下载 ZIP:内含九张数据表、各文件校验值(SHA-256)、Excel 查看用的副本和可在自己电脑运行的分析脚本。冻结不会阻止之后的合法更正;需要同一版本时,从“数据快照(冻结的数据版本)”列表重新下载。

运行方法和全部输出文件见下方进阶与详细手册 · 冻结与分析。

病种模块

创建项目时选择的模块决定显示哪些专病字段。模块名称不是诊断、入组资格或统计模型已验证的证明;先确认数据字典、随访时间和允许缺失的字段,再开始采集。

GENERAL:通用或混合病种

适合尚无专病模块的登记,如局灶节段性肾小球硬化、ANCA 相关血管炎、糖尿病肾病或混合队列。可记录通用基线、随访、化验、用药与事件;专病评分和结局口径需按研究方案另行制定。

随机分组字段

分组、随机编号和随机日期只用于登记已按获批方案产生的分配结果。系统不生成随机序列,不实施分配隐藏,也不能替代临床试验管理系统。

常见问题

问题与回答集中放在详细手册 · 常见问题,避免两处说法不一致:

需要协助时,请写明页面、操作步骤、错误提示和时间,先遮盖研究数据、完整随访链接和密码,发送到 china@kidneysphere.com。

进阶:本地分析、研究方案、多中心合并与标准字段

以下内容面向统计人员、数据协调人员和技术负责人;日常录入用不到。

在自己电脑上运行分析脚本

  1. 保留原始 ZIP 不改动,解压后先读包内 README.md 与 analysis/README.md。
  2. 安装 Python 3.11 或 3.12,在包根目录(包含 analysis/ 的目录)建立独立环境并安装锁定版本的依赖,然后运行 python analysis/run_analysis.py。完整命令见详细手册 · 本地运行。
  3. 只有看到 DESCRIPTIVE_REVIEW_OK,新生成的 analysis/outputs/run-时间/ 才是本次结果;先看 RUN_LOG.json(人数、输入校验值、知情同意筛选人数)和 qc_issues.csv。
  4. analysis/data/ 是给脚本读的原值 CSV;用 Excel 查看请打开 excel_safe/ 中的副本,不要用它替换分析输入。

按研究方案判定终点

分析包附带 analysis/protocol_template.json。模板中的缓解定义和 eGFR 下降阈值只是示例,全部标为“需课题负责人确认”。课题负责人复制模板,逐项核对基线取值、阈值、持续确认次数与间隔、截尾规则,填写确认人和日期后,运行 python analysis/run_analysis.py --protocol analysis/my_protocol.json。脚本输出 endpoints_per_protocol.csv 与 timepoints_per_protocol.csv,并把方案全文和 SHA-256 写入 RUN_LOG.json。未确认的章节不计算。这是按方案参数的程序化判定,不等于终点委员会的人工裁定。

多中心合并

各中心在自己的项目中冻结导出,由数据协调中心(DCC)收齐各中心的六张核心 CSV,运行包内 merge_centers.py 校验合并;出现 MERGE_OK 后再对合并目录运行分析。合并保留各中心原始项目、中心代码与研究编号,冲突会阻止合并而不是自动覆盖。步骤见详细手册 · 多中心合并。

标准字段与原始来源

化验记录可保留检验项目代码(如 LOINC)、原始数值与单位;基因记录保留报告中的基因、HGVS 命名、转录本与合子状态。字段齐全不等于结果已获专业解释,不要为填满字段编造代码;分析脚本不做遗传变异解释。基因数据涉及人类遗传资源管理,工作台默认不开放录入。详见详细手册 · 专业字段。

用于注册类临床试验?

本系统用于研究随访登记,未按药物注册试验的电子数据采集要求(如 GCP、21 CFR Part 11 电子记录与电子签名、CDISC SDTM/ADaM 标准输出)进行验证。用于此类试验前需单独评估,私有化部署本身也不等于满足这些要求。